Shintaro Kisaragi es un hikikomori de 18 años que lleva encerrado en su habitación dos años con la única compañía de su ordenador y su conexión a internet. Desde hace un año Shintaro vive 'preso' De una ciberchica llamada Ene, la cual aparece en su pantalla de ordenador. Cuando por primera vez en dos años sale de su habitación y llega al centro comercial, entra en contacto con el grupo de adolescentes llamado 'Mekakushi dan', quienes consiguen sabotear un secuestro con sus Super poderes visuales. Y una vez revelado su secreto, no pueden dejar le marchar a Shintaro como si nada.
